合作信息
生物醫(yī)藥高性能并行計(jì)算及創(chuàng)新應(yīng)用平臺(tái)
發(fā)布單位:南開大學(xué)
所屬行業(yè):電子信息、新一代信息技術(shù)
合作信息類型:意向合作
機(jī)構(gòu)類型:高等院校
供求關(guān)系:供應(yīng)
合作信息期限:2016-12
參考價(jià)格:面議
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合作信息簡(jiǎn)介
數(shù)學(xué)院 梁科 信息 邵秀麗
生物醫(yī)藥的發(fā)展遇到計(jì)算性能達(dá)不到規(guī)模要求的瓶頸,該項(xiàng)目選擇以生物醫(yī)藥學(xué)相關(guān)算法的高性能并行計(jì)算為目標(biāo),利用高性能并行計(jì)算系統(tǒng),對(duì)生物醫(yī)藥進(jìn)行了深入的研究。利用現(xiàn)代生物及化學(xué)信息學(xué)手段開展了抗病毒藥物的設(shè)計(jì)工作,其中包括SARS,HIV以及廣譜藥物的研究。擁有自主開發(fā)的于模代數(shù)理論的快速大規(guī)模多重比對(duì)算法SMA。在計(jì)算機(jī)藥物設(shè)計(jì)方面,開發(fā)了DDS—SIM模塊中具有自主知識(shí)產(chǎn)權(quán)的算法,并擁有一套小分子和已有藥物化合物的結(jié)構(gòu)和生物特性的化學(xué)數(shù)據(jù)庫(kù)。
創(chuàng)新點(diǎn):
1.利用高性能并行計(jì)算系統(tǒng)所開發(fā)的應(yīng)用系統(tǒng)"基于WEB的超算服務(wù)平臺(tái)"設(shè)計(jì)思路新穎合理,實(shí)現(xiàn)了集群監(jiān)控,用戶可直接通過公共服務(wù)平臺(tái)調(diào)用超算;
2.在腫瘤基因的研究方面,自主開發(fā)基于模代數(shù)理論的多重比對(duì)算法SMA。在比對(duì)規(guī)模、計(jì)算速度與優(yōu)化指標(biāo)等性質(zhì)明顯優(yōu)于現(xiàn)有的多重比對(duì)軟件包;
3.構(gòu)建了制劑成品率與制劑工藝參數(shù)間的非線性模型,并尋優(yōu)。建設(shè)了中藥生產(chǎn)質(zhì)量?jī)?yōu)化控制并行計(jì)算、分析和服務(wù)平臺(tái),支持中藥生產(chǎn)質(zhì)量的優(yōu)化控制。
取得的成效:
該項(xiàng)目部分成果在天津市天和醫(yī)院的"SIRS與MODS"研究中應(yīng)用,并成功地實(shí)施了“痹祺膠囊傳統(tǒng)工藝流程優(yōu)化”、“京萬紅傳統(tǒng)工藝流程優(yōu)化”、“精制銀翹解毒片生產(chǎn)線設(shè)備參數(shù)優(yōu)化”以及“中藥滴丸制劑過程建模、優(yōu)化及應(yīng)用研究”等項(xiàng)目的研發(fā),取得了明顯的經(jīng)濟(jì)效益和有重大實(shí)用價(jià)值的成果。
該項(xiàng)目獲2006年度天津市科學(xué)技術(shù)進(jìn)步獎(jiǎng)二等獎(jiǎng)。
生物醫(yī)藥的發(fā)展遇到計(jì)算性能達(dá)不到規(guī)模要求的瓶頸,該項(xiàng)目選擇以生物醫(yī)藥學(xué)相關(guān)算法的高性能并行計(jì)算為目標(biāo),利用高性能并行計(jì)算系統(tǒng),對(duì)生物醫(yī)藥進(jìn)行了深入的研究。利用現(xiàn)代生物及化學(xué)信息學(xué)手段開展了抗病毒藥物的設(shè)計(jì)工作,其中包括SARS,HIV以及廣譜藥物的研究。擁有自主開發(fā)的于模代數(shù)理論的快速大規(guī)模多重比對(duì)算法SMA。在計(jì)算機(jī)藥物設(shè)計(jì)方面,開發(fā)了DDS—SIM模塊中具有自主知識(shí)產(chǎn)權(quán)的算法,并擁有一套小分子和已有藥物化合物的結(jié)構(gòu)和生物特性的化學(xué)數(shù)據(jù)庫(kù)。
創(chuàng)新點(diǎn):
1.利用高性能并行計(jì)算系統(tǒng)所開發(fā)的應(yīng)用系統(tǒng)"基于WEB的超算服務(wù)平臺(tái)"設(shè)計(jì)思路新穎合理,實(shí)現(xiàn)了集群監(jiān)控,用戶可直接通過公共服務(wù)平臺(tái)調(diào)用超算;
2.在腫瘤基因的研究方面,自主開發(fā)基于模代數(shù)理論的多重比對(duì)算法SMA。在比對(duì)規(guī)模、計(jì)算速度與優(yōu)化指標(biāo)等性質(zhì)明顯優(yōu)于現(xiàn)有的多重比對(duì)軟件包;
3.構(gòu)建了制劑成品率與制劑工藝參數(shù)間的非線性模型,并尋優(yōu)。建設(shè)了中藥生產(chǎn)質(zhì)量?jī)?yōu)化控制并行計(jì)算、分析和服務(wù)平臺(tái),支持中藥生產(chǎn)質(zhì)量的優(yōu)化控制。
取得的成效:
該項(xiàng)目部分成果在天津市天和醫(yī)院的"SIRS與MODS"研究中應(yīng)用,并成功地實(shí)施了“痹祺膠囊傳統(tǒng)工藝流程優(yōu)化”、“京萬紅傳統(tǒng)工藝流程優(yōu)化”、“精制銀翹解毒片生產(chǎn)線設(shè)備參數(shù)優(yōu)化”以及“中藥滴丸制劑過程建模、優(yōu)化及應(yīng)用研究”等項(xiàng)目的研發(fā),取得了明顯的經(jīng)濟(jì)效益和有重大實(shí)用價(jià)值的成果。
該項(xiàng)目獲2006年度天津市科學(xué)技術(shù)進(jìn)步獎(jiǎng)二等獎(jiǎng)。